起源
國立中正大學78年7月1日正式成立，78年7月6日奉行政院主計處核定本室員額，成立「會計室」，首任會計主任由李耀林主任兼任。
102年1月1日起，因應「主計機構人員設置管理條例」修正通過，並經行政院101年12月25日令定自102年1月1日施行，本室自102年度起名稱由「會計室」修正為「主計室」，「會計主任 」亦修正為「主任」。
歷屆主任
| 職稱 | 姓名 | 上任日期 | 卸任日期 |
|---|---|---|---|
| 會計主任 | 李耀林 | 78年7月(籌備處) | 78年11月 |
| 會計主任 | 王秀英 | 78年11月 | 90年8月17日 |
| 會計主任 | 邱宏昌 | 90年8月17日 | 92年5月16日 |
| 代理會計主任 | 謝勝文 | 92年5月16日 | 92年9月29日 |
| 會計主任 | 簡淑媛 | 92年9月29日 | 95年1月2日 |
| 代理會計主任 | 蕭瓊芬 | 95年1月2日 | 95年3月22日 |
| 會計主任 | 謝啟章 | 95年3月22日 | 98年11月18日 |
| 主任 | 胡文騏 | 98年11月18日 | 106年5月16日 |
| 主任 | 謝勝文 | 106年5月16日 | 迄今 |
職掌
承辦全校歲計、會計並兼辦統計等業務，自創校至85會計年度止，屬公務預算型態，86會計年度起以非營業基金型態實施校務基金。
工作理念
本著服務與經費公開之理念，以支援教學、研究為宗旨，隨時研究改進，減化行政程序提升工作效率。
發展方向
實施校務基金後，己積極推動會計業務電腦化，擬配合成本概念建立績效指標，提升經費使用績效。