國立中正大學78年7月1日正式成立，78年7月6日奉行政院主計處核定本室員額，成立「會計室」，首任會計主任由李Ｏ林主任兼任。
102年1月1日起，因應「主計機構人員設置管理條例」修正通過，並經行政院101年12月25日令定自102年1月1日施行，本室自102年度起名稱由「會計室」修正為「主計室」，「會計主任 」亦修正為「主任」。

承辦全校歲計、會計並兼辦統計等業務，自創校至85會計年度止，屬公務預算型態，86會計年度起以非營業基金型態實施校務基金。

本著服務與經費公開之理念，以支援教學、研究為宗旨，隨時研究改進，減化行政程序提升工作效率。

實施校務基金後，已積極推動會計業務電腦化，擬配合成本概念建立績效指標，提升經費使用績效。